В эпицентре хаоса появляется Альдо, отец Линкольна. Он спасает сына от беспощадного Келлермана и раскрывает шокирующую правду. Существует могущественная Компания, которая управляет правительством США из тени. Линкольн стал всего лишь пешкой в их жестокой игре. Полиция приближается, и Линкольн использует её как прикрытие, чтобы не попасть в руки врага. Альдо исчезает бесследно, а Линкольна снова отправляют в мрачные стены Фокс-Ривер, на этот раз в изоляцию.
Скофилд отчаянно нуждается в ключе от лазарета. Апольскис отказывается помогать из-за постоянного террора со стороны Авокадо. Тогда Ника Волек берёт дело в свои руки. Она крадёт ключ у Сары Танкреди. Но Сара заподозрила неладное и меняет замок, разрушая грандиозный план. Апольскис решает проблему радикальным способом, и месть Авокадо становится неизбежной. Абруцци возвращается после ранения, пугая Бэгвелла, но ради общей цели решает заключить временный мир.
Скофилд всё же доверяет Апольскису. Однако тот, не выдержав давления Беллика, раскрывает тайну о давно подготовленном побеге. Беллик спешно находит лазейку, и теперь всё предприятие оказывается под угрозой срыва.
